La fase fluorada presenta una alta selectividad y una mayor retención hacia compuestos estrechamente relacionados, incluyendo compuestos fluorados aromáticos y otros compuestos halogenados no aromáticos. Puede utilizarse en fase reversa y proporciona una separación alternativa y complementaria a la realizada en columnas C8 o C18 para numerosos analitos. La fase fluorada ofrece una mejor separación de compuestos iónicos y polares que las fases alquílicas. La fase fluorada puede proporcionar diferentes órdenes de elución, lo que aumenta la selectividad para compuestos difíciles de separar.
